Kenraalikuvernööri Pietari Brahe perusti Punkalaitumen pitäjän vuonna 1639. Tällöin eri kylät, joista osa kuului naapuripitäjiin, yhdistyivät. Samana vuonna muodostettiin myös itsenäinen kirkkoherrakunta ja vähän myöhemmin rakennettiin kirkko.
Vielä 1800-luvulla keskustassa oli Kuparinjärvi, joka kuivattiin. Sen jälkeen Punkalaitumen keskustan ainoa vesistö, Punkalaitumenjoki, on puskenut savimaiden läpi kohti Kokemäenjokea. Vuosisatojen ajan joen rantamilla on harjoitettu maanviljelystä ja karjanhoitoa. Keskustan alueella oli vielä 1900-luvun alkupuolella kymmenen tuulimyllyä. Tuulimylly, joka nykyään seisoo Yli-Kirran talonpoikaismuseoalueella, on siirretty sinne Liitsolasta. Yli-Kirra edustaa tyypillistä 1800-luvun satakuntalaista maalaistaloa.
Läänin ensimmäinen kansakoulu perustettiin Sarkkilaan, missä rakennus edelleen on matkailukäytössä. Mäenpään työväentalo, suojeluskuntatalo Vartiola, kunnantalo, pappila ja ensimmäinen urheilukenttä rakennettiin 1900-luvun alkupuolella.
Punkalaitumella käytetään sanontaa "mennään pitäjälle", kun käydään esimerkiksi asioimassa pitäjän keskustassa. Sanonnasta on peräisin kyläyhdistyksemme nimi.